chore: консолидация незакоммиченной работы (биохимия + System Health + lab/textbooks)

Зафиксирована накопленная незакоммиченная работа рабочего дерева, КРОМЕ файлов
учебника «Химия 7» (migration 046, chemistry_7_*.html, chem7_svg.js, тест —
оставлены незакоммиченными по запросу).

Включает: модуль биохимии (ядро BIO, 3D VSEPR, химдвижок, баланс, challenges,
пути из БД), System Health Level 1 (вердикт/мониторинг), а также frontend-
страницы и lab/textbooks-правки параллельной сессии.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>

backend/scripts/seed_biochem_pathways.js

@@ -0,0 +1,42 @@
+'use strict';
+/*
+ * Сид метаболических путей в bio_pathways.
+ * Источник данных — backend/scripts/data/biochem_pathways.json (изначально
+ * извлечён из инлайн-объекта PATHWAYS; теперь это самодостаточный источник
+ * правды, не зависящий от фронта). Каждый путь — документ data_json.
+ * Идемпотентно (upsert по slug): повторный запуск синхронизирует данные.
+ *
+ * Запуск: node backend/scripts/seed_biochem_pathways.js
+ */
+const db = require('../src/db/db');
+const P = require('./biochem_pathways_data');
+
+const upsert = db.prepare(`INSERT INTO bio_pathways (slug, name, color, ord, data_json)
+  VALUES (@slug, @name, @color, @ord, @data_json)
+  ON CONFLICT(slug) DO UPDATE SET
+    name=excluded.name, color=excluded.color, ord=excluded.ord, data_json=excluded.data_json`);
+
+const slugs = Object.keys(P);
+let n = 0;
+db.exec('BEGIN');
+try {
+  slugs.forEach((slug, idx) => {
+    const p = P[slug];
+    upsert.run({
+      slug,
+      name: p.name || slug,
+      color: p.color || '#9B5DE5',
+      ord: idx,
+      data_json: JSON.stringify(p),
+    });
+    n++;
+  });
+  db.exec('COMMIT');
+} catch (e) {
+  db.exec('ROLLBACK');
+  throw e;
+}
+
+console.log(`biochem pathways seed: ${n} путь(ей) — ${slugs.join(', ')}`);
+console.log('в БД:', db.prepare('SELECT slug, name, LENGTH(data_json) AS bytes FROM bio_pathways ORDER BY ord').all()
+  .map(r => `${r.slug}(${r.bytes}b)`).join('  '));