chore: консолидация незакоммиченной работы (биохимия + System Health + lab/textbooks)

Зафиксирована накопленная незакоммиченная работа рабочего дерева, КРОМЕ файлов
учебника «Химия 7» (migration 046, chemistry_7_*.html, chem7_svg.js, тест —
оставлены незакоммиченными по запросу).

Включает: модуль биохимии (ядро BIO, 3D VSEPR, химдвижок, баланс, challenges,
пути из БД), System Health Level 1 (вердикт/мониторинг), а также frontend-
страницы и lab/textbooks-правки параллельной сессии.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>

backend/src/db/migrations/044_bio_user_pathway.sql

@@ -0,0 +1,16 @@
+-- 044_bio_user_pathway.sql
+-- Прогресс прохождения метаболических путей (Learn-режим biochem-pathways).
+-- Раньше прогресс не сохранялся; теперь шаг и факт завершения хранятся на
+-- пользователя по ключу пути (glycolysis / krebs / oxidation / synthesis ...).
+-- Награда (XP) начисляется один раз при первом завершении пути.
+
+CREATE TABLE IF NOT EXISTS bio_user_pathway (
+  user_id    INTEGER NOT NULL REFERENCES users(id) ON DELETE CASCADE,
+  pathway    TEXT    NOT NULL,
+  step       INTEGER NOT NULL DEFAULT 0,
+  completed  INTEGER NOT NULL DEFAULT 0,
+  updated_at TEXT    NOT NULL DEFAULT (datetime('now')),
+  PRIMARY KEY (user_id, pathway)
+);
+
+CREATE INDEX IF NOT EXISTS idx_bio_user_pathway ON bio_user_pathway(user_id);

backend/src/db/migrations/045_bio_pathways.sql

@@ -0,0 +1,15 @@
+-- 045_bio_pathways.sql
+-- Метаболические пути как данные (вместо ~700 строк хардкода в
+-- biochem-pathways.html). Каждый путь — самодостаточный документ (граф узлов
+-- и рёбер + шаги Learn-режима с квизами) в data_json; страница грузит их через
+-- API. Document-подход выбран намеренно: путь всегда читается целиком,
+-- реляционных запросов к узлам/рёбрам нет.
+
+CREATE TABLE IF NOT EXISTS bio_pathways (
+  id        INTEGER PRIMARY KEY AUTOINCREMENT,
+  slug      TEXT    NOT NULL UNIQUE,
+  name      TEXT    NOT NULL,
+  color     TEXT    NOT NULL DEFAULT '#9B5DE5',
+  ord       INTEGER NOT NULL DEFAULT 0,
+  data_json TEXT    NOT NULL DEFAULT '{}'
+);