Два дефекта, из-за которых 3D читался как плоская диаграмма:
- painter-сортировка была по возрастанию z (ближние первыми) — дальние
атомы рисовались поверх ближних. Теперь единый список примитивов
(атомы + половинки связей) сортируется по убыванию z (дальние первыми).
- связи были тонкими плоскими линиями. Теперь — затенённые «цилиндры»:
толстый штрих с поперечным градиентом (центр светлее, края темнее),
двухцветные (каждая половина под цвет своего атома) — фирменный вид
ball-and-stick. Ширина зависит от перспективы (ближе — толще).
- усилена перспектива (fov 900→700), добавлен тёмный ободок сфер для объёма.
Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>