Files
Learn_System/backend/scripts
Maxim Dolgolyov b29b395a96 feat(biochem): Фаза 4 (4.1-4.3) — пути метаболизма из БД (API), хардкод убран
Перенос данных путей из ~700 строк инлайн-объекта PATHWAYS в biochem-pathways.html
в БД. Document-подход: каждый путь — самодостаточный документ data_json (граф
узлов/рёбер + шаги с квизами); путь всегда читается целиком, реляционных
запросов нет — нормализация не нужна.

- migration 045_bio_pathways: таблица bio_pathways(slug, name, color, ord, data_json).
- backend/scripts/biochem_pathways_data.js: данные 4 путей (извлечены из инлайн-
  объекта, теперь самодостаточный источник правды).
- seed_biochem_pathways.js: идемпотентный upsert по slug.
- biochemController.getPathways + GET /biochem/pathways (карта slug->данные).
- js/api.js: biochemGetPathways.
- biochem-pathways.html: инлайн PATHWAYS (-238 строк) заменён на загрузку из API
  в init (loadPathways); форма данных идентична — рендер не изменён.

Проверено: API отдаёт 4 пути в форме фронта, сидер идемпотентен.

Co-Authored-By: Claude Opus 4.8 (1M context) <noreply@anthropic.com>
2026-05-30 17:39:36 +03:00
..

backend/scripts

Operational scripts for LearnSpace backend.

Cron setup (production)

# Daily backup at 4am
0 4 * * *  /path/to/repo/backend/scripts/backup.sh

# Weekly verification at 6am Sunday (cron mails on non-zero exit)
0 6 * * 0  /path/to/repo/backend/scripts/verify-backup.sh

Scripts

backup.sh

Creates a safe SQLite snapshot via VACUUM INTO. Keeps last 7 backups (configurable via KEEP=14).

./backup.sh                        # default: ../data/learnspace.db → ../../backups/
./backup.sh /path/to/db /path/to/backups
KEEP=14 ./backup.sh

verify-backup.sh

Restores the latest backup to /tmp, runs PRAGMA integrity_check, compares row counts vs production.

Exit codes:

  • 0 — all checks passed
  • 2 — no backup files found
  • 3 — latest backup older than 48h (backup job may have stopped)
  • 4integrity_check failed (backup is corrupt)
  • 5 — user count diverged >5% from production
./verify-backup.sh
BACKUP_DIR=/custom/backups PROD_DB=/custom/db.sqlite ./verify-backup.sh

check-route-auth.js

Scans src/routes/*.js for :id-bearing routes without an auth-guard middleware. Fails if new unprotected routes exceed the current baseline.

npm run lint:routes

import-content.js (coming in Task 8)

Imports question collections from YAML manifests into the database.

npm run import:content -- ../content/phys/ct-2024.yaml

Deploy order (first time / fresh server)

npm install
npm run migrate
npm run seed:permissions
npm start